Organizační struktura
Sekce pro evropské záležitosti má na starosti koordinační a analytickou přípravu českých pozic na jednání v Evropské unii.
Sekci řídí vrchní ředitel PhDr. Štěpán Černý a tvoří ji pět útvarů:
Odbor koordinace evropských politik (OKE)
OKE se podílí především na formulování a provádění politiky ČR ve vztahu k EU, koordinuje zajišťování práv a plnění závazků vyplývajících z členství ČR v Evropské unii a vytváří zázemí pro činnost Výboru pro EU. Odbor dále koordinuje přípravu mandátů, instrukcí a pozic pro jednání orgánů EU a zpracovává stanoviska k jednotlivým materiálům.
Ředitelem OKE je Ing. Ondřej Matoušek.
Odbor evropské institucionální a právní podpory (OIP)
OIP je odpovědný za koordinaci institucionální agendy (instituce EU, reformy, spolupráce s Evropským parlamentem), problematiku evropské dimenze právního státu, podporu Čechů v institucích EU a implementaci Výstupové dohody Spojeného království. Rovněž zpracovává právní analýzy a provádí analytický monitoring k vybraným evropským tématům.
Ředitelem OIP je Mgr. Štěpán Pech.
Odbor věcných politik EU (OVP)
OVP zajišťuje koordinaci pozic ČR v oblasti politiky soudržnosti ve spolupráci s Ministerstvem pro místní rozvoj (MMR) coby gestorem této politiky. Vykonává roli národního kontaktního místa přímo řízených programů Nástroj pro technickou podporu (TSI) a Občané, rovnost, práva a hodnoty (CERV). Je gestorem nařízení o Nástroji pro oživení a odolnost, evropského semestru a koordinace hospodářských politik EU a podílí se také na tvorbě, koordinaci a monitoringu provádění Fiskálně-strukturálního plánu ČR.
Ředitelkou OVP je Mgr. Ing. Markéta Krčmářová.
Odbor komunikace o evropských záležitostech (OEZ)
OEZ zprostředkovává široké veřejnosti informace o Evropské unii. Využívá k tomu internetové stránky, platformy sociálních sítí a tzv. integrovaný informační systém, jehož součástí je webový portál Tvoříme Evropu, síť regionálních Eurocenter a bezplatná telefonní linka Eurofon. Odbor také organizačně zaštiťuje činnost Národního konventu o EU a pořádá konference a semináře s evropskou tématikou.
Ředitelkou OEZ je Mgr. et Mgr. Eva Húsková.
Oddělení evropské digitální agendy (OEDA)
OEDA plní koordinační úlohu v oblasti digitální agendy EU a dohlíží na aktuální digitální témata především v evropském, ale i v mezinárodním kontextu. V rámci své činnosti se zabývá tématy, jako jsou umělá inteligence, role online platforem, cíle evropské digitální dekády 2030, chování na internetu, cloudové služby, digitální práva a zásady, kybernetická bezpečnost a další horizontální témata digitální agendy EU.